মসজিদের নামেই স্পষ্ট যে, এই মসজিদটি সংযুক্ত আরব আমিরাতের প্রতিষ্ঠাতা এবং আবু ধাবির শাসকের নির্দেশে নির্মাণ করা হয়েছে। শেখ যায়েদ মসজিদটি নতুন ইসলামী স্থাপত্যের একটি উদাহরণ।